MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC8

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018684	AAAG	2	8	23	30	75 %	0 %	25 %	0 %	407708755
2	NC_018684	CAAA	2	8	54	61	75 %	0 %	0 %	25 %	407708755
3	NC_018684	GTATA	2	10	82	91	40 %	40 %	20 %	0 %	407708755
4	NC_018684	ATTT	2	8	92	99	25 %	75 %	0 %	0 %	407708755
5	NC_018684	AGT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708755
6	NC_018684	TTCAC	2	10	139	148	20 %	40 %	0 %	40 %	407708755
7	NC_018684	T	7	7	429	435	0 %	100 %	0 %	0 %	407708756
8	NC_018684	A	6	6	446	451	100 %	0 %	0 %	0 %	407708756
9	NC_018684	G	6	6	452	457	0 %	0 %	100 %	0 %	407708756
10	NC_018684	T	8	8	467	474	0 %	100 %	0 %	0 %	407708756
11	NC_018684	CAT	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708756
12	NC_018684	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708756
13	NC_018684	TACC	2	8	523	530	25 %	25 %	0 %	50 %	407708756
14	NC_018684	TTC	2	6	559	564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708756
15	NC_018684	AG	3	6	1183	1188	50 %	0 %	50 %	0 %	407708757
16	NC_018684	CT	3	6	1207	1212	0 %	50 %	0 %	50 %	407708757
17	NC_018684	ATA	2	6	1510	1515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708758
18	NC_018684	A	6	6	1541	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	407708758
19	NC_018684	T	6	6	1747	1752	0 %	100 %	0 %	0 %	407708759
20	NC_018684	ATTA	2	8	1763	1770	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
21	NC_018684	GAA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
22	NC_018684	GCT	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708759
23	NC_018684	AT	3	6	1821	1826	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
24	NC_018684	AT	5	10	1858	1867	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
25	NC_018684	ATA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
26	NC_018684	CAG	2	6	1908	1913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708759
27	NC_018684	A	7	7	1933	1939	100 %	0 %	0 %	0 %	407708759
28	NC_018684	ATT	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708759
29	NC_018684	AT	3	6	1997	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
30	NC_018684	GAT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
31	NC_018684	A	6	6	2078	2083	100 %	0 %	0 %	0 %	407708759
32	NC_018684	GCT	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708759
33	NC_018684	A	7	7	2104	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	407708759
34	NC_018684	AGAAA	2	10	2137	2146	80 %	0 %	20 %	0 %	407708759
35	NC_018684	A	6	6	2144	2149	100 %	0 %	0 %	0 %	407708759
36	NC_018684	CAA	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708759
37	NC_018684	ATA	2	6	2178	2183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
38	NC_018684	TAA	2	6	2305	2310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
39	NC_018684	TCTA	2	8	2311	2318	25 %	50 %	0 %	25 %	407708759
40	NC_018684	TAA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
41	NC_018684	GAT	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
42	NC_018684	TA	3	6	2433	2438	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
43	NC_018684	AAGA	2	8	2567	2574	75 %	0 %	25 %	0 %	407708759
44	NC_018684	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708759
45	NC_018684	TA	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	407708759
46	NC_018684	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
47	NC_018684	AAG	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
48	NC_018684	TGA	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
49	NC_018684	ATAACT	2	12	2742	2753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407708759
50	NC_018684	AAG	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
51	NC_018684	A	7	7	2809	2815	100 %	0 %	0 %	0 %	407708759
52	NC_018684	CAA	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708759
53	NC_018684	ATG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708760
54	NC_018684	A	8	8	3636	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	407708760
55	NC_018684	C	6	6	3653	3658	0 %	0 %	0 %	100 %	407708760
56	NC_018684	T	6	6	3659	3664	0 %	100 %	0 %	0 %	407708760
57	NC_018684	A	8	8	3675	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	407708760
58	NC_018684	GTGAA	2	10	3963	3972	40 %	20 %	40 %	0 %	407708761
59	NC_018684	TAC	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708761
60	NC_018684	TTTA	2	8	4005	4012	25 %	75 %	0 %	0 %	407708761
61	NC_018684	TATAC	2	10	4020	4029	40 %	40 %	0 %	20 %	407708761
62	NC_018684	TTTG	2	8	4050	4057	0 %	75 %	25 %	0 %	407708761
63	NC_018684	CTTT	2	8	4081	4088	0 %	75 %	0 %	25 %	407708761
64	NC_018684	TTGA	2	8	4153	4160	25 %	50 %	25 %	0 %	407708762
65	NC_018684	A	8	8	4177	4184	100 %	0 %	0 %	0 %	407708762
66	NC_018684	GAA	3	9	4309	4317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
67	NC_018684	ATT	2	6	4419	4424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708762
68	NC_018684	TCT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708762
69	NC_018684	AGT	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708762
70	NC_018684	TGAAA	2	10	4581	4590	60 %	20 %	20 %	0 %	407708762
71	NC_018684	TAA	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708762
72	NC_018684	ACAA	2	8	4676	4683	75 %	0 %	0 %	25 %	407708762
73	NC_018684	GAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
74	NC_018684	GAA	2	6	4723	4728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
75	NC_018684	GAA	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
76	NC_018684	ATGC	2	8	4781	4788	25 %	25 %	25 %	25 %	407708762
77	NC_018684	ATA	3	9	4832	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708762
78	NC_018684	AAG	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
79	NC_018684	TA	3	6	4917	4922	50 %	50 %	0 %	0 %	407708762
80	NC_018684	AT	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	407708762
81	NC_018684	GAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
82	NC_018684	AAAT	2	8	5069	5076	75 %	25 %	0 %	0 %	407708762
83	NC_018684	A	6	6	5140	5145	100 %	0 %	0 %	0 %	407708762
84	NC_018684	GAA	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
85	NC_018684	AGA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
86	NC_018684	GAA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
87	NC_018684	T	6	6	5887	5892	0 %	100 %	0 %	0 %	407708763
88	NC_018684	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708763
89	NC_018684	TTC	2	6	6023	6028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
90	NC_018684	AAT	2	6	6049	6054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708763
91	NC_018684	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708763
92	NC_018684	TGG	3	9	6098	6106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708763
93	NC_018684	TAGT	2	8	6126	6133	25 %	50 %	25 %	0 %	407708763
94	NC_018684	CTT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
95	NC_018684	CAACAT	2	12	6148	6159	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407708763
96	NC_018684	TCT	2	6	6171	6176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
97	NC_018684	T	7	7	6191	6197	0 %	100 %	0 %	0 %	407708763
98	NC_018684	CTTTTT	2	12	6229	6240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407708763
99	NC_018684	GAA	2	6	6261	6266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708763
100	NC_018684	GA	3	6	6286	6291	50 %	0 %	50 %	0 %	407708763
101	NC_018684	GTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	25 %	0 %	407708763
102	NC_018684	T	7	7	6303	6309	0 %	100 %	0 %	0 %	407708763
103	NC_018684	CACATC	2	12	6320	6331	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407708763
104	NC_018684	TTA	2	6	6358	6363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708763
105	NC_018684	TAC	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708764
106	NC_018684	TTC	2	6	6687	6692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
107	NC_018684	TCT	2	6	6745	6750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
108	NC_018684	CTT	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
109	NC_018684	T	7	7	6792	6798	0 %	100 %	0 %	0 %	407708764
110	NC_018684	ATTT	2	8	6861	6868	25 %	75 %	0 %	0 %	407708764
111	NC_018684	TTC	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
112	NC_018684	AT	3	6	6977	6982	50 %	50 %	0 %	0 %	407708764
113	NC_018684	AT	3	6	7014	7019	50 %	50 %	0 %	0 %	407708764
114	NC_018684	CTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
115	NC_018684	ATT	2	6	7098	7103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708764
116	NC_018684	GCAT	2	8	7149	7156	25 %	25 %	25 %	25 %	407708764
117	NC_018684	TTC	3	9	7194	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
118	NC_018684	TTC	2	6	7209	7214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
119	NC_018684	CTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
120	NC_018684	TTGT	2	8	7254	7261	0 %	75 %	25 %	0 %	407708764
121	NC_018684	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708764
122	NC_018684	TTTCA	2	10	7347	7356	20 %	60 %	0 %	20 %	407708764
123	NC_018684	ACT	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708764
124	NC_018684	AGA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708764
125	NC_018684	TAA	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708764
126	NC_018684	TTC	3	9	7620	7628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
127	NC_018684	T	8	8	7753	7760	0 %	100 %	0 %	0 %	407708764
128	NC_018684	TCAA	2	8	7777	7784	50 %	25 %	0 %	25 %	407708764

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.